La Dirección de Archivo Colonial es el órgano encargado de organizar, conservar, describir y servir la documentación colonial y notarial desde el Siglo XVI hasta el Siglo XIX (1533 - 1821).

Posee aproximadamente 1500 m.l. de documentación, siendo sus principales fondos documentales: Real Audiencia, Superior Gobierno, Compañía de Jesús, Temporalidades, Real Hacienda, campesinado, Protocolos Notariales, Eclesiástico, Minería, entre otros.

Posee aproximadamente 1500 m.l. de documentación, siendo sus principales fondos documentales: Real Audiencia, Superior Gobierno, Compañía de Jesús, Temporalidades, Real Hacienda, Campesinado, Protocolos Notariales, Eclesiástico, Minería, entre otros.

          

En este archivo se halla manuscritos de Francisco Pizarro, Túpac Amaru, Micaela Bastidas, Gracilazo de la Vega, San Martín de Porres, Micaella Villegas (La Perricholi).

Tiene a su cargo la Sala de Investigaciones, Sala de Usuarios, Biblioteca y Hemeroteca “Guillermo Durand Flórez”.